Ypäjän kunnanvaakunan piirsi professori, taidegraafikko Aukusti Tuhka ja se vahvistettiin käyttöön v. 1949.
Halkoisen kilven vasemmassa sinisessä kentässä on kuvattuna hopeinen maalaiskirkon kellotapuli, oikeassa hopeisessa kentässä punainen tähkä.
Vaakunan aihe kumpuaa Ypäjän historiasta ja elinkeinosta. Vaakunassa kuvataan kohtuullisen tarkasti v. 1901 purettu vanha Perttulan kappelikirkon kellotapuli.
Tähkä puolestaan viittaa kunnassa aina harjoitettuun maatalouteen.
Vaakunan historia on erityinen, sillä vaakuna on yksi ensimmäisistä suomenkielisten maalaiskuntien vaakunoista.
Vaakuna on muista kunnanvaakunoista poikkeava myös pisaramallisella muodoltaan;
nykyisiä kuntavaakunoiden heraldisia sääntöjä se ei täytä, mutta on tullut vahvistetuksi sellaisena ennen vaatimusten vakiintumista ja on sikäli harvinainen.